Els escenaris aplicables de Bacillus inclouen principalment els aspectes següents:
Industry Dairy: els bacteris Bacillus dominen la llet crua, principalment de l’entorn de la granja lacti. Durant el processament de lactis, aquests bacteris poden escapar de la pasteurització i Ultra - esterilització a alta temperatura i utilitzar nutrients a la llet per sobreviure i germinar.
Aquacultura: Bacillus té un paper important en l'aqüicultura. Poden prevenir i controlar eficaçment les malalties de l’aqüicultura, descompondre substàncies nocives en secretar enzims i substàncies beneficioses i promoure el creixement i la reproducció de microorganismes a l’aigua, jugant així un paper de prevenció de malalties. Apte per a aqüicultura d’aigua dolça i d’aigua de mar, pot accelerar el creixement d’algues i controlar les malalties a les aigües d’aqüicultura.
Millora del sòl: els bacteris de bacil també s’utilitzen àmpliament al sòl. Poden descompondre la matèria orgànica, promoure l’equilibri dels microorganismes del sòl, millorar l’estructura del sòl i augmentar la fertilitat del sòl.
Investigació en tecnologiabioengineering: Bacillus subtilis és una espècie model del gènere Bacillus, que s'utilitza àmpliament en la diferenciació de cèl·lules i la investigació en tecnologia de bioenginyeria. Com que està àmpliament present en diversos ambients i és resistent a la temperatura freda, alta i els desinfectants comuns, sovint s’utilitza com a organisme model per estudiar la replicació i la transformació del cromosoma bacterià.