Les espècies representatives de Bacillus inclouen Bacillus cereus, Bacillus subtilis i Bacillus thuringiensis.
Aquestes espècies representatives tenen un paper important en les aplicacions biològiques i industrials:
Bacillus cereus: aquest bacteri es troba àmpliament al sòl i té la capacitat de degradar la matèria orgànica. Sovint s’utilitza per a la bioremediació i la purificació ambiental.
Bacillus subtilis: es tracta d’una important soca de producció industrial que pot produir proteases i amilases i s’utilitza àmpliament en aliments, medicina i biotecnologia.
Bacillus thuringiensis: aquest bacteri s’utilitza en l’agricultura per produir pesticides biològics, especialment per a insectes. Té un fort efecte insecticida i s’utilitza àmpliament en el control de plagues.
A més, el gènere Bacillus també inclou algunes altres espècies importants, com Bacillus stearothermophilus, que és termòfil i sovint s’utilitza per a la desinfecció espacial i la preparació d’indicadors biològics.